一、自然資源部東北亞古生物演化重點實驗室（以下簡稱實驗室），是自然資源部于2012年5月批準建設的。為了貫徹和落實自然資源部對重點實驗室的建設與運行管理的要求，保障重點實驗室的各項工作有序開展，取得高水平的科研和教學成果，參照《自然資源部重點實驗室建設與運行管理辦法》，結合本重點實驗室的實際情況，特制訂本制度。
       二、實驗室以取得國際一流水平的标志性、原創性科研成果和培養高層次優秀人才為目标，力争建成為以古生物學研究為主體的、國内領先、國際知名的“國際化”古生物學研究平台和學術交流平台。
       三、實驗室貫徹執行“開放、流動、聯合、競争”的運行管理機制，面向國内外開放。
       四、實驗室實行依托單位領導、學術委員會指導下的主任負責制。實驗室學術委員會實行科研集體領導制，主要職能是審議實驗室的發展目标、研究方向、發展規劃、重大學術活動、年度工作計劃和年度總結；參與重要學術活動，指導學術研究；對實驗室的發展、合作、開放提出意見和建議，促進實驗室科學化、規範化發展。學術委員會委員由國内外知名專家學者擔任，學術委員會一般每年召開一次全體會議，實到人數不少于三分之二。
       五、實驗室實行主任負責制。學術上對學術委員會負責，對實驗室進行全面管理，包括科學研究，學術活動，人員聘任，行政以及各項規章制度和管理條例的制訂，研究和決定實驗室的重大問題。
       六、實驗室研究隊伍建設，應根據實驗室學科發展需要，以多種形式吸引國内外優秀人才，特别是高水平優秀學術帶頭人，鼓勵人才流動，加強國際合作，不斷提高科學研究水平與實驗室整體競争能力。實驗室固定人員招聘使用實行“合同聘任制”；人員管理采用“擇優錄用與淘汰制”（年更新淘汰率約5%）。
       七、實驗室下設8個分研究室和1個技術室：（1）古植物與孢粉研究室、（2）古昆蟲研究室、（3）古鳥類研究室、（4）綜合古脊椎動物研究室、（5）兩栖與爬行動物研究室、（6）早期生命與古無脊椎動物研究室、（7）化石能源與環境研究室、（8）化石保護與博物館研究室、（9）綜合技術實驗室（包括電鏡室、磨片室、化石修複室及8個分實驗室）。
       八、實驗室設主任1名、副主任3名、辦公室主任1名。實驗室主任在學術委員會指導下，組織和協調實驗室的全面工作，主持日常工作。3名副主任的職責為：副主任（一）協助主任制訂實驗室計劃、分管科研與成果管理、合作與交流、學術活動；副主任（二）分管實驗室人才培養及教育、學科建設；副主任（三）負責實驗室的儀器設備管理、對外開放與服務、規章制度建設。辦公室主任協助實驗室主任進行日常事務的管理，負責實驗室行政、後勤及安全工作。實驗室設科研、外事和财務秘書各1人，在主任、副主任及辦公室主任領導下處理相關日常事務：科研秘書協助主任、分管副主任進行科研管理、負責課題計劃安排、成果統計與管理；外事秘書協助主任、分管副主任負責外事及學術交流活動的組織實施；财務秘書協助主任管理全室資産、财務工作，實驗室主任為實驗室财務總負責人。
       九、積極開展國際交流合作，鼓勵科研人員聯合攻關，充分利用實驗室的環境和條件，實現優勢互補，提高實驗室的開放度。
       十、經費管理。實驗室公共運行費主要由國土資源部下撥實驗室運行經費解決，按學校财務管理辦法進行管理；課題經費按國家規定以課題為單位實行全成本核算，按學校科研經費管理辦法進行管理。
       十一、學術活動。實驗室要保持濃厚的學術氛圍，廣泛開展學術交流活動，組織科研人員積極參加重要的國際、國内學術會議。特别重視在國際一流刊物和國内核心刊物上發表高水平的學術論文和科學專著，以擴大本室在國内外的影響。
      十二、加強檔案資料的積累。按照國家對科技檔案的要求認真做好科技檔案的收集、整理和歸檔工作，做到系統完整；按時向國土資源部和主管部門報送有關資料或數據。
      十三、在本總則和學術委員會指導下，制訂實驗室的各項管理制度。